32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44112 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_44112  predicted protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  43.9 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  48.65 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  40.26 
 
 		 76 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06074  polyadenylation factor subunit CstF64, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09100)  28.57 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.4649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  34.09 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 		 88 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9806  predicted protein  35.59 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 90 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 		 88 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  31.91 
 
 		 125 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  31.25 
 
 		 572 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  35.62 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  30 
 
 		 112 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 		 88 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  33.85 
 
 		 291 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  29.73 
 
 		 104 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  31.51 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_27034  predicted protein  31.17 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64186  normal  0.132821 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  25.93 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  32.84 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  30.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  30.11 
 
 		 89 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  30.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  32.05 
 
 		 441 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  28.77 
 
 		 90 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 87 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  32 
 
 		 732 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48462  predicted protein  33.9 
 
 		 372 aa  42  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237219  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  35.38 
 
 		 357 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04346  ribosomal biogenesis protein Gar2 (AFU_orthologue; AFUA_4G06350)  29.87 
 
 		 445 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>