28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30500 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  100 
 
 		 390 aa  802    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67215  predicted protein  55.41 
 
 		 388 aa  465  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45970  predicted protein  30.55 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.154337 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  24.69 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  23.67 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  22.17 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  21.72 
 
 		 270 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  21.67 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 		 268 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  21.7 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  23.24 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  21.28 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  20 
 
 		 293 aa  46.6  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  23.04 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  22.33 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  20.71 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  22.82 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  22.11 
 
 		 286 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 		 299 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  20.2 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>