32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29268 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29268  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  100 
 
 		 647 aa  1297    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106866  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29269  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  38.43 
 
 		 656 aa  357  3.9999999999999996e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.159066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29216  Leucine rich repeat protein  24.14 
 
 		 719 aa  158  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.55505 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31980  predicted protein  25.41 
 
 		 690 aa  155  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.25184 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31744  predicted protein  23.91 
 
 		 672 aa  136  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.743293  normal  0.568196 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31745  predicted protein  28.63 
 
 		 660 aa  135  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.442814  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28415  hypothetical protein  26.15 
 
 		 677 aa  131  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.460739  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28340  Leucine rich repeat protein  24.47 
 
 		 704 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.669391  normal  0.295604 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28339  hypothetical protein  26.12 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.908779  normal  0.0915689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.92 
 
 		 1107 aa  57.4  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30.14 
 
 		 755 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30.14 
 
 		 755 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30.14 
 
 		 731 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  29.45 
 
 		 755 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.81 
 
 		 1041 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  30.38 
 
 		 766 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  31.01 
 
 		 760 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.32 
 
 		 772 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  29.19 
 
 		 779 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  29.88 
 
 		 765 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  29.88 
 
 		 542 aa  47.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  29.45 
 
 		 765 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  30.38 
 
 		 760 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1389 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  25.14 
 
 		 630 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  29.75 
 
 		 766 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  29.35 
 
 		 318 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  29.11 
 
 		 755 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  29.65 
 
 		 692 aa  44.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  27.81 
 
 		 479 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  27.02 
 
 		 867 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>