80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34923 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  100 
 
 		 312 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  29.78 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  29.85 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  29.17 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  27.6 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  28.21 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  27.6 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  27.6 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  34.23 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  30.93 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  28.12 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  27.87 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  28.12 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  29.83 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  29.52 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  30.41 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  28.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  29.28 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  28.74 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  30.21 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  30.63 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  26.32 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  28.06 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.22 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  27.08 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.38 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  28.82 
 
 		 236 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  36.45 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  29.87 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  27.62 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  30.13 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  26.8 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  28.06 
 
 		 243 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  29.27 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  31.58 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  27.08 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  28.25 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  24.59 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  29.27 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  26.55 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  27.22 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  29.46 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  27.54 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.84 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  28.66 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  28.66 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  30.58 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  36.05 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  28.49 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  28.14 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  24.24 
 
 		 506 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  25.81 
 
 		 539 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  25.1 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  29.14 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  28.02 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  24.79 
 
 		 513 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.85 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  27.81 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  27.16 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  31.9 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  30.43 
 
 		 513 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  26.54 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  26.47 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  26.49 
 
 		 511 aa  43.5  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  26.72 
 
 		 516 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  26.92 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  29.63 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  28.16 
 
 		 517 aa  42.7  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  27.33 
 
 		 240 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  28.45 
 
 		 509 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 213 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.25 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  27.68 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>