More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1690 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  100 
 
 		 495 aa  1028    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  55.23 
 
 		 499 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_2087  predicted protein  95.39 
 
 		 217 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37780  Thymidylate synthase  58.84 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0107754 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07028  hypothetical protein similar to thymidylate synthase (Broad)  55.31 
 
 		 674 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01230  thymidylate synthase  61.39 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0538613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  52.46 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  52.82 
 
 		 264 aa  301  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  53.36 
 
 		 264 aa  299  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  52.82 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 264 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  53.52 
 
 		 264 aa  296  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  52.46 
 
 		 264 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  52.46 
 
 		 264 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  52.48 
 
 		 264 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  53.52 
 
 		 264 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 267 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  52.11 
 
 		 264 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  52.65 
 
 		 264 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  50.88 
 
 		 286 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 264 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  52.3 
 
 		 264 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  52.65 
 
 		 264 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  53.17 
 
 		 264 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  52.65 
 
 		 264 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  53 
 
 		 264 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  53.17 
 
 		 264 aa  290  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  48.77 
 
 		 290 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  52.46 
 
 		 264 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  52.46 
 
 		 264 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  290  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  52.48 
 
 		 264 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 264 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 264 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 264 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  51.94 
 
 		 264 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 318 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  49.12 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  50.35 
 
 		 264 aa  286  5.999999999999999e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  51.76 
 
 		 264 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  49.15 
 
 		 285 aa  286  7e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  50.68 
 
 		 283 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 264 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  49.3 
 
 		 264 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  49.83 
 
 		 277 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  46.13 
 
 		 318 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  50.7 
 
 		 264 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  53.19 
 
 		 264 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  50.52 
 
 		 280 aa  282  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  49.65 
 
 		 264 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  50 
 
 		 264 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  48.48 
 
 		 274 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  51.42 
 
 		 264 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  47.06 
 
 		 283 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  51.06 
 
 		 264 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2047  thymidylate synthase  49.65 
 
 		 264 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 264 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  49.65 
 
 		 264 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  50.7 
 
 		 264 aa  280  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  51.41 
 
 		 264 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  48.82 
 
 		 277 aa  279  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  50.85 
 
 		 273 aa  279  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  49.65 
 
 		 264 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  47.81 
 
 		 277 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  49.65 
 
 		 264 aa  277  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  50.71 
 
 		 267 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  50 
 
 		 264 aa  276  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  52.13 
 
 		 290 aa  276  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  48.59 
 
 		 264 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  50.34 
 
 		 283 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  48.94 
 
 		 264 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  50 
 
 		 264 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  49.3 
 
 		 264 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  49.3 
 
 		 264 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  45.71 
 
 		 320 aa  274  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  50.51 
 
 		 273 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  48.94 
 
 		 264 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  50.35 
 
 		 264 aa  273  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  49.65 
 
 		 264 aa  273  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  47.46 
 
 		 277 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  49.65 
 
 		 264 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  50.88 
 
 		 274 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  49.3 
 
 		 264 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  49.65 
 
 		 264 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5412  thymidylate synthase  50.71 
 
 		 262 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  51.24 
 
 		 271 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  48.94 
 
 		 264 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  48.94 
 
 		 264 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  48.94 
 
 		 264 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  48.94 
 
 		 264 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>