More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1824 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1824  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
425 aa  871    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  70.24 
 
 
434 aa  608  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  69.52 
 
 
434 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  68.81 
 
 
434 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  70.57 
 
 
431 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  68.81 
 
 
434 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  69.12 
 
 
435 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  68.96 
 
 
430 aa  586  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  69.45 
 
 
433 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  69.14 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  69.69 
 
 
430 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 
426 aa  567  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  68.9 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.11 
 
 
431 aa  560  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
430 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
430 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
428 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
427 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2706  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
428 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0844  Phosphopyruvate hydratase  68.32 
 
 
429 aa  546  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  65.31 
 
 
425 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 
429 aa  544  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  66.03 
 
 
427 aa  545  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  66.19 
 
 
435 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.59 
 
 
428 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
430 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 
427 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
428 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 
427 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
428 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
429 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  65 
 
 
431 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.11 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  65 
 
 
431 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
430 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
428 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  65.48 
 
 
430 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
429 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.07 
 
 
427 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
425 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
427 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
433 aa  537  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.07 
 
 
427 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64 
 
 
429 aa  537  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  64.11 
 
 
428 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.83 
 
 
429 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 
428 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0210  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 
430 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
427 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  63.4 
 
 
427 aa  531  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  64.2 
 
 
432 aa  532  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
424 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
431 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
431 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 
433 aa  531  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  62.65 
 
 
433 aa  531  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  62.68 
 
 
423 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  64.59 
 
 
426 aa  532  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.11 
 
 
429 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
429 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
427 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 
429 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 
428 aa  528  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  63.88 
 
 
426 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02261  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 
430 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.65688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  65.31 
 
 
427 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
426 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 
427 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
425 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 
430 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 
429 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 
431 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  63.88 
 
 
427 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
429 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
431 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 
429 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  65.55 
 
 
427 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  65.16 
 
 
426 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.79 
 
 
428 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  63.98 
 
 
426 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  64.13 
 
 
427 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 
431 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 
429 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 
422 aa  527  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  64.83 
 
 
425 aa  524  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 
429 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
431 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  64.59 
 
 
425 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  60.33 
 
 
429 aa  521  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  64.13 
 
 
431 aa  523  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  62.2 
 
 
427 aa  522  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 
425 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 
427 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
431 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
431 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
425 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>