More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1677 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1677  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 418 aa  847    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.575292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  59.76 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  56.56 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  57.35 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  56.83 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  55.74 
 
 		 395 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  55.26 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  52.88 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.32 
 
 		 650 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.48 
 
 		 646 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  50.24 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  50.36 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  50.36 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  49.4 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  50.36 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  48.41 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  49.52 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  48.56 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0736  hypothetical protein  46.39 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  48.44 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  48.44 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  48.68 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  48.2 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  47.2 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  48.44 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  46.52 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  48.68 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  48.44 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  49.76 
 
 		 400 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  48.2 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.8 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  46.88 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  48.68 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  48.2 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  48.44 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  46.89 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  48.1 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  48.44 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  48.2 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  47.24 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  46.47 
 
 		 401 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  46.72 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  46.41 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  46.78 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  46.08 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.93 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.12 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  48.17 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  44.74 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  46.41 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  46.41 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  45.75 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  45.93 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  46.27 
 
 		 435 aa  363  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  47.69 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01246  Phosphoglycerate kinase (EC 2.7.2.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P11977]  45.97 
 
 		 421 aa  362  9e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  45.74 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  45.48 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  47.12 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  45.74 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  45.8 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  49.28 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  45.45 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  45.91 
 
 		 399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  45.58 
 
 		 397 aa  356  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  45.58 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  46.54 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  44.5 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  43.3 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02220  phosphoglycerate kinase, putative  45.13 
 
 		 454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  45.08 
 
 		 397 aa  352  7e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0416  phosphoglycerate kinase  44.23 
 
 		 400 aa  351  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1753  phosphoglycerate kinase  43.41 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.093261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 396 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  46.41 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  46.3 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  45.08 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  44.36 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1715  phosphoglycerate kinase  42.33 
 
 		 419 aa  348  7e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  45.26 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  45.58 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  44.12 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48983  predicted protein  47.18 
 
 		 448 aa  346  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.26 
 
 		 655 aa  345  6e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  45.15 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  44.26 
 
 		 400 aa  345  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 654 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  44.79 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  44.6 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  46.41 
 
 		 395 aa  342  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1589  phosphoglycerate kinase  44.84 
 
 		 400 aa  342  8e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  46.39 
 
 		 394 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3826  phosphoglycerate kinase  45.35 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1736  phosphoglycerate kinase  44.84 
 
 		 400 aa  341  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>