More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3826 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3826  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
420 aa  829    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02220  phosphoglycerate kinase, putative  62.17 
 
 
454 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78267  3-phosphoglycerate kinase  60.96 
 
 
416 aa  494  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01246  Phosphoglycerate kinase (EC 2.7.2.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P11977]  60.58 
 
 
421 aa  480  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.57 
 
 
655 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  50.96 
 
 
394 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  52.43 
 
 
399 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  52.43 
 
 
399 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  51.56 
 
 
396 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 
398 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50.84 
 
 
394 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 
402 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  49.4 
 
 
400 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.18 
 
 
403 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.93 
 
 
400 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
396 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  49.64 
 
 
401 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.93 
 
 
400 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 
399 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  47.72 
 
 
397 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 
402 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  47.49 
 
 
395 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  50.61 
 
 
401 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  49.76 
 
 
393 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
397 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  48.8 
 
 
394 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  48.79 
 
 
400 aa  363  3e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 
401 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  47.95 
 
 
393 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  46.04 
 
 
397 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  48.56 
 
 
394 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  48.2 
 
 
393 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.08 
 
 
650 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  49.28 
 
 
396 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 
394 aa  358  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  49.28 
 
 
396 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  46.99 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.19 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  47.84 
 
 
394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  48.8 
 
 
396 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  47.6 
 
 
394 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.26 
 
 
646 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 
394 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  48.31 
 
 
443 aa  353  4e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  48.58 
 
 
395 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  49.64 
 
 
397 aa  352  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  46.21 
 
 
402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  50.24 
 
 
399 aa  352  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.6 
 
 
394 aa  352  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48983  predicted protein  49.17 
 
 
448 aa  352  8.999999999999999e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 
394 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 
394 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  46.28 
 
 
397 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  47.39 
 
 
401 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 
405 aa  350  3e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 
396 aa  349  4e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 
395 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  46.54 
 
 
397 aa  349  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  46.51 
 
 
393 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  46.51 
 
 
392 aa  348  8e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  45.93 
 
 
395 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  47 
 
 
397 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  48.1 
 
 
435 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  45.93 
 
 
397 aa  346  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 
402 aa  346  6e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  47.14 
 
 
396 aa  345  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.35 
 
 
402 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 
420 aa  345  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1715  phosphoglycerate kinase  43.84 
 
 
419 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  46.06 
 
 
398 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  47.13 
 
 
395 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 
406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  45.58 
 
 
402 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 
403 aa  343  4e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  48.92 
 
 
398 aa  343  4e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  46.88 
 
 
394 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  46.52 
 
 
404 aa  342  9e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  47.04 
 
 
399 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  43.75 
 
 
393 aa  341  2e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 
398 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1677  phosphoglycerate kinase  45.35 
 
 
418 aa  339  5e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.575292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  45.11 
 
 
399 aa  339  5e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  46.59 
 
 
399 aa  338  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 
399 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  44.87 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1753  phosphoglycerate kinase  44.6 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.093261  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  43.81 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.160418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  46.27 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  44.87 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  45.08 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  45.58 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  45.58 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  46.39 
 
 
396 aa  336  5.999999999999999e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  45.54 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  45.89 
 
 
399 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>