More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1589 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1589  dihydropteroate synthase  100 
 
 
281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.864925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  51.28 
 
 
273 aa  299  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  52.01 
 
 
283 aa  297  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3663  dihydropteroate synthase  53.09 
 
 
288 aa  295  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  51.49 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  49.29 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  50.56 
 
 
286 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 
283 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 
272 aa  267  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 
275 aa  246  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  45.35 
 
 
278 aa  233  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  45.65 
 
 
280 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
278 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 
287 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  41.28 
 
 
400 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
279 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
279 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  43.84 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  42.16 
 
 
277 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  42.48 
 
 
281 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 
258 aa  209  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
376 aa  208  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
280 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  36.98 
 
 
278 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
280 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 
279 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  42.06 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  40.44 
 
 
282 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 
397 aa  199  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  39.25 
 
 
266 aa  199  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  39.33 
 
 
277 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  39.7 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  40.94 
 
 
278 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  42.22 
 
 
283 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 
286 aa  195  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  38.95 
 
 
277 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  39.18 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
282 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  37.02 
 
 
277 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
278 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
282 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
282 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
282 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
282 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  40.58 
 
 
278 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  38.69 
 
 
274 aa  191  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  40.74 
 
 
283 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
277 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  38.81 
 
 
277 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
282 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  38.81 
 
 
277 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  35.29 
 
 
276 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
282 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  37.35 
 
 
259 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  44.15 
 
 
306 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 
394 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  38.95 
 
 
277 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 
277 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  38.2 
 
 
277 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
347 aa  188  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  38.2 
 
 
277 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  38.58 
 
 
277 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  38.2 
 
 
284 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
277 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  38.4 
 
 
282 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  41.33 
 
 
393 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 
277 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  40.22 
 
 
290 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  40 
 
 
283 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  36.56 
 
 
286 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  37.74 
 
 
277 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  37.74 
 
 
277 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  43.51 
 
 
286 aa  185  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  38.29 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  36.46 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  39.05 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  38.25 
 
 
356 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1374  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 
380 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000647265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
283 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  41.48 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 
400 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12107  predicted protein  39.22 
 
 
460 aa  182  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 
286 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 
283 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  38.85 
 
 
314 aa  182  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
412 aa  182  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  37.64 
 
 
279 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  40 
 
 
283 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  38.49 
 
 
281 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 
402 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 
277 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>