46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5478 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  100 
 
 		 579 aa  1169    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  33.55 
 
 		 584 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.4 
 
 		 533 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  31.7 
 
 		 608 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  30.88 
 
 		 595 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  29.93 
 
 		 692 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  30.19 
 
 		 588 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  28.5 
 
 		 568 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  28.85 
 
 		 585 aa  188  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  28.67 
 
 		 568 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.42 
 
 		 1570 aa  170  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.69 
 
 		 1391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.69 
 
 		 1349 aa  166  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.69 
 
 		 580 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  26.69 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.65 
 
 		 585 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.35 
 
 		 584 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.15 
 
 		 639 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  26.92 
 
 		 587 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.11 
 
 		 567 aa  88.2  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  20.64 
 
 		 558 aa  87.8  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.35 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  20.7 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.67 
 
 		 572 aa  64.3  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  19.63 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  22.62 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  21.85 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  19.08 
 
 		 554 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.81 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.8 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.15 
 
 		 559 aa  54.7  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  21.19 
 
 		 588 aa  53.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.62 
 
 		 585 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.23 
 
 		 561 aa  49.7  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.2 
 
 		 596 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  20.2 
 
 		 596 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.25 
 
 		 590 aa  47.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  24.04 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.34 
 
 		 747 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  20.2 
 
 		 596 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  24.04 
 
 		 568 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  25.44 
 
 		 574 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.74 
 
 		 573 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.38 
 
 		 895 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  20.93 
 
 		 607 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.6 
 
 		 549 aa  44.3  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>