61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3190 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  81 
 
 		 202 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  70.15 
 
 		 203 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  70.44 
 
 		 203 aa  302  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  66.01 
 
 		 203 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  66.5 
 
 		 202 aa  275  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  63.96 
 
 		 201 aa  270  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  63.96 
 
 		 201 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  63.96 
 
 		 201 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  62.94 
 
 		 201 aa  268  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  63.45 
 
 		 201 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  71.43 
 
 		 176 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  63.45 
 
 		 201 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  70.29 
 
 		 176 aa  265  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  65.52 
 
 		 202 aa  256  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  62 
 
 		 202 aa  256  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  65.34 
 
 		 1097 aa  232  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  54.9 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  60.57 
 
 		 176 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  57 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  56.65 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  56.44 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  53.54 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  43.43 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  40.7 
 
 		 266 aa  134  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  37.77 
 
 		 220 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  32.57 
 
 		 225 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  40 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  45 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  33.16 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  40.85 
 
 		 169 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  33.71 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  34.29 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  34.29 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  34.16 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  39.31 
 
 		 184 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  34.95 
 
 		 219 aa  95.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  40.41 
 
 		 433 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  31.36 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  40.98 
 
 		 137 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  43.1 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  36.55 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  31.66 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  40.71 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  38.38 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  32.65 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  30.94 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  31.49 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  35.14 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  30.94 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  40.91 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  36.36 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  26.04 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  50.88 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  33.33 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 649 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 		 354 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1576  phage tail protein I  28.57 
 
 		 193 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2886  phage tail protein I  28.57 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3330  Phage tail protein I  36.54 
 
 		 422 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  36.07 
 
 		 346 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>