60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00850 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  99 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  97.51 
 
 
201 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  93.53 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  91.54 
 
 
201 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  62.76 
 
 
203 aa  271  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  63.96 
 
 
203 aa  270  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  63.64 
 
 
202 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  59.9 
 
 
203 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  60.8 
 
 
202 aa  258  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  60.2 
 
 
202 aa  252  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  55.28 
 
 
203 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  56.28 
 
 
202 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  54.5 
 
 
205 aa  232  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  59.88 
 
 
1097 aa  222  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  53.96 
 
 
204 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  56.98 
 
 
176 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  57.06 
 
 
176 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  55.81 
 
 
176 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  53.47 
 
 
208 aa  209  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  49.75 
 
 
201 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  51.23 
 
 
202 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  45.14 
 
 
177 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  36.82 
 
 
266 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  44.85 
 
 
258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  37.57 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  36.41 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  35.45 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  36.81 
 
 
225 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  35.33 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  35.33 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  33.51 
 
 
234 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  35.38 
 
 
219 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  41.73 
 
 
169 aa  104  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  36.22 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  44.07 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  44.26 
 
 
137 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  32.12 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  31.53 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  34.5 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  39.46 
 
 
433 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  38.36 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  40.35 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  42.11 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  36.59 
 
 
222 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  41.3 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  29.52 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  33.93 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  30.81 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  30.81 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  30.81 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  49.12 
 
 
419 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  29.69 
 
 
158 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  25.55 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3330  Phage tail protein I  36.67 
 
 
422 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1576  phage tail protein I  29.47 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2886  phage tail protein I  29.47 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  32.47 
 
 
747 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  28.04 
 
 
354 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>