24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3330 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3330  Phage tail protein I  100 
 
 
422 aa  844    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  25.55 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  36.14 
 
 
258 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  35.71 
 
 
234 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  32.43 
 
 
219 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  38.46 
 
 
203 aa  46.6  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  36.67 
 
 
201 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  40.38 
 
 
202 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  36.67 
 
 
201 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  40.38 
 
 
177 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  33.33 
 
 
228 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  37.74 
 
 
203 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  32.98 
 
 
208 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  32.1 
 
 
201 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  42.31 
 
 
205 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  31.33 
 
 
202 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  32.1 
 
 
201 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  33.66 
 
 
181 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  34.82 
 
 
184 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  32.91 
 
 
220 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  32.71 
 
 
183 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  32.1 
 
 
201 aa  43.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  32.1 
 
 
201 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  35.85 
 
 
176 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.025863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>