55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01349 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  100 
 
 
169 aa  341  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  59.39 
 
 
433 aa  188  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  50.3 
 
 
185 aa  181  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  50.3 
 
 
185 aa  181  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  50.3 
 
 
185 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  50.92 
 
 
169 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  44.85 
 
 
184 aa  151  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  43.64 
 
 
183 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  43.29 
 
 
184 aa  141  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  40.58 
 
 
266 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  46.15 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  42.75 
 
 
203 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  32.43 
 
 
158 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  39.19 
 
 
208 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  41.73 
 
 
201 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  41.73 
 
 
201 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  34.78 
 
 
225 aa  104  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  36.25 
 
 
203 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  40 
 
 
181 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  41.01 
 
 
201 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  41.01 
 
 
201 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  38.85 
 
 
203 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  40.85 
 
 
203 aa  101  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  39.86 
 
 
1097 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  38.41 
 
 
176 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  40.44 
 
 
202 aa  97.8  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  39.13 
 
 
204 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  39.29 
 
 
201 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  39.39 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  39.57 
 
 
201 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  38.41 
 
 
201 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  36.73 
 
 
176 aa  94.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  42.37 
 
 
202 aa  94  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  37.76 
 
 
176 aa  94  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  33.12 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  42.19 
 
 
202 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  36.69 
 
 
202 aa  88.6  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  44.04 
 
 
234 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  29.41 
 
 
208 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  33.97 
 
 
228 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  31.33 
 
 
258 aa  84.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  35.94 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  32.58 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  32.77 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  31.93 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  39.62 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  38.71 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  31.51 
 
 
192 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3668  bacteriophage tail protein I  45.9 
 
 
65 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  33.33 
 
 
211 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  36.59 
 
 
187 aa  60.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  43.86 
 
 
419 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1576  phage tail protein I  34.15 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2886  phage tail protein I  34.15 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  26.77 
 
 
354 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>