59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1290 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  100 
 
 		 181 aa  360  9e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  44.77 
 
 		 266 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  40.35 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  39.2 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  39.11 
 
 		 225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  37.14 
 
 		 203 aa  121  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  38.29 
 
 		 203 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  38.15 
 
 		 201 aa  120  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  38.15 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  37.57 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  37.57 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  37.65 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  37.57 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  40.46 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  37.93 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  36.99 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  40 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  38.04 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  40 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  38.51 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  35.09 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  40.13 
 
 		 433 aa  111  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  34.48 
 
 		 202 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  34.48 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  36 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  37.9 
 
 		 1097 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  34.5 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  36.24 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  40 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  36.84 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  45.1 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  37.34 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  37.34 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  37.34 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  44.35 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  34.76 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  38.26 
 
 		 240 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  34.66 
 
 		 234 aa  88.2  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  36.43 
 
 		 169 aa  87.4  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  37.09 
 
 		 270 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  35.88 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  33.33 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  32.73 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  45.16 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  44.35 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  42.11 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  35.57 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  34.78 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  30.81 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  31.25 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  43.21 
 
 		 419 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  23.91 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  24.39 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  24.39 
 
 		 210 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  24.39 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3330  Phage tail protein I  32 
 
 		 422 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  37.78 
 
 		 630 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2510  hypothetical protein  27.1 
 
 		 213 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0933  hypothetical protein  26.26 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>