55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1138 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  97.3 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  97.63 
 
 		 169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  55.11 
 
 		 433 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  50.3 
 
 		 169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  44.81 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  46.89 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  43.82 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  46.98 
 
 		 266 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  46.46 
 
 		 137 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  36.31 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  46.9 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  35.87 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  35.33 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  35.33 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  38.26 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  37.5 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  44.44 
 
 		 258 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  33.7 
 
 		 201 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  37.34 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  36 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  33.15 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  37.06 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  37.16 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  34.29 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  35.63 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  35.63 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  39.04 
 
 		 203 aa  99  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  34.1 
 
 		 1097 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  34.01 
 
 		 225 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  37.33 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  34.69 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  38.51 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  34.93 
 
 		 176 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  33.52 
 
 		 228 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  37.34 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  36.3 
 
 		 234 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  34.48 
 
 		 222 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  33.9 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  32.76 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  37.67 
 
 		 202 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  36.49 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  29.44 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  34.83 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  31.58 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  32.16 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  35.14 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  39 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  27.22 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3668  bacteriophage tail protein I  39.34 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1576  phage tail protein I  35.19 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2886  phage tail protein I  35.19 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  43.86 
 
 		 419 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  28.89 
 
 		 448 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>