30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2886 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2886  phage tail protein I  100 
 
 
193 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1576  phage tail protein I  97.41 
 
 
193 aa  387  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  46.67 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  56.99 
 
 
210 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  56.99 
 
 
210 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  56.99 
 
 
210 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  29.71 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2905  prophage MuMc02 tail fiber domain-containing protein  48.31 
 
 
436 aa  71.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.32834  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  35.19 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  35.19 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  35.29 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  44.9 
 
 
270 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  44.9 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  34.07 
 
 
169 aa  48.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  32.65 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  34.15 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  24.85 
 
 
266 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  34.02 
 
 
184 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  29.47 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  34.02 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  29.47 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  25.58 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  30.91 
 
 
433 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  35 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  29.47 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  29.47 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  35 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  27.37 
 
 
201 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  27.37 
 
 
201 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  28.57 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>