53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4134 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  57.78 
 
 
228 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  35.14 
 
 
185 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  34.03 
 
 
266 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  34.54 
 
 
185 aa  95.5  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  34.54 
 
 
185 aa  95.5  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  36.81 
 
 
169 aa  89  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  35.9 
 
 
433 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  39.02 
 
 
137 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  38.21 
 
 
184 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  35.88 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  40 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  38.51 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  39.17 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  36.93 
 
 
202 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  33.33 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  35.44 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  29.77 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  36.59 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  35.15 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  36.59 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  36.59 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  36.59 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  37.1 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  34.97 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  36.64 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  34.96 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  35.57 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  27.17 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  36.97 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  29.21 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  32.4 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  37.68 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  36.13 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  35.29 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  40.96 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  34.45 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  34.48 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  26.67 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  30.29 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  34.67 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  30.88 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  33.86 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  32.53 
 
 
270 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  33.62 
 
 
176 aa  62.4  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  37.8 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  37.35 
 
 
1097 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  33.33 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  34.04 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3668  bacteriophage tail protein I  37.04 
 
 
65 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  41.18 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  41.18 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  41.18 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>