65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3819 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  100 
 
 
202 aa  414  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  66.5 
 
 
203 aa  275  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  65.02 
 
 
203 aa  270  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  65.5 
 
 
202 aa  268  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  61.62 
 
 
203 aa  267  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  60.8 
 
 
201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  60.8 
 
 
201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  60.8 
 
 
201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  59.8 
 
 
201 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  59.8 
 
 
201 aa  255  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  58.29 
 
 
201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  56.72 
 
 
202 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  60.92 
 
 
176 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  56.93 
 
 
202 aa  227  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  55.17 
 
 
203 aa  225  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  56.74 
 
 
1097 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  52.48 
 
 
204 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  49.5 
 
 
205 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  56 
 
 
176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  55.43 
 
 
176 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  48.26 
 
 
208 aa  185  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  51.5 
 
 
202 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  49.01 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  44.51 
 
 
177 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  38.76 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  40.11 
 
 
220 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  43.9 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  31.63 
 
 
258 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  43.33 
 
 
184 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  43.09 
 
 
137 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  32 
 
 
234 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  39.73 
 
 
183 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  37.16 
 
 
185 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  37.16 
 
 
185 aa  101  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  37.16 
 
 
185 aa  101  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  37.33 
 
 
433 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  36.6 
 
 
219 aa  98.2  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  41.43 
 
 
169 aa  97.8  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  37.25 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  31.94 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  35.77 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  35.81 
 
 
208 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  29.61 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  37.8 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  49.37 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  31.52 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  31.52 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  31.52 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  48.39 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  32.45 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  43.08 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  31.3 
 
 
270 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  50 
 
 
419 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  27.34 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  35.63 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1576  phage tail protein I  36 
 
 
193 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2886  phage tail protein I  32.65 
 
 
193 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  36.07 
 
 
354 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1873  Phage tail protein  28.03 
 
 
524 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0677099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3330  Phage tail protein I  31.33 
 
 
422 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0948  Phage tail protein  28.18 
 
 
524 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.138323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  36.07 
 
 
346 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1221  hypothetical protein  29.91 
 
 
649 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3668  bacteriophage tail protein I  41.07 
 
 
65 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0933  hypothetical protein  31.17 
 
 
213 aa  41.2  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>