35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0232 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  100 
 
 
206 aa  420  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  36.9 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  36.93 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  36.9 
 
 
210 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  33.82 
 
 
176 aa  72  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  26.04 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  32.28 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  28.39 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  27.7 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  27.01 
 
 
203 aa  61.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  27.34 
 
 
202 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  26.28 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  26.28 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  25.68 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  26.71 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  31.75 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1221  hypothetical protein  27.78 
 
 
649 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  25.55 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  25.55 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  24.82 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  24.46 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  25.52 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  24.29 
 
 
1097 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0933  hypothetical protein  32.17 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  25.14 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  21.88 
 
 
266 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  24.71 
 
 
176 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2510  hypothetical protein  31 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  22.45 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  27.54 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  22.02 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  23.91 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  38.16 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  28.09 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  25.83 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>