13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1221 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1221  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1353    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2510  hypothetical protein  40.49 
 
 		 213 aa  114  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0933  hypothetical protein  37.04 
 
 		 213 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  35.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  35.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  35.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  27.78 
 
 		 206 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  29.45 
 
 		 208 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  32.56 
 
 		 158 aa  48.5  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  30.59 
 
 		 176 aa  47  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  33.33 
 
 		 203 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  29.84 
 
 		 1097 aa  45.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  29.46 
 
 		 225 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>