161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1863 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01125  peptidase T  78.38 
 
 		 408 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  78.62 
 
 		 408 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  100 
 
 		 410 aa  853    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  77.26 
 
 		 409 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  95.37 
 
 		 410 aa  820    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  77.51 
 
 		 409 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  77.7 
 
 		 422 aa  682    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  85.82 
 
 		 423 aa  755    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  78.38 
 
 		 408 aa  684    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  79.71 
 
 		 411 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  78.38 
 
 		 408 aa  684    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  78.62 
 
 		 409 aa  685    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  79.46 
 
 		 409 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  78.62 
 
 		 422 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  79.71 
 
 		 411 aa  712    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  83.37 
 
 		 423 aa  734    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  79.71 
 
 		 411 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  78.38 
 
 		 408 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  78.62 
 
 		 422 aa  685    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  78.38 
 
 		 408 aa  681    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  77.75 
 
 		 409 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  77.75 
 
 		 409 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  77.51 
 
 		 409 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  60.98 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  61.03 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  57.32 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  59.27 
 
 		 410 aa  488  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  58.42 
 
 		 407 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  58.48 
 
 		 409 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  55.33 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  54.68 
 
 		 411 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  52.81 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  53.55 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  52.96 
 
 		 406 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  54.5 
 
 		 410 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  52.71 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  52.32 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  53.19 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  54.59 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  52.94 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  50.85 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  51.34 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  52.37 
 
 		 410 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  51.87 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  50.98 
 
 		 407 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  51.37 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  51.37 
 
 		 410 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  51.24 
 
 		 410 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  51.62 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  51.37 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  51.24 
 
 		 410 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  51.37 
 
 		 412 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  51.24 
 
 		 410 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0445  peptidase T  50.99 
 
 		 405 aa  403  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0466341 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  50.99 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  49.51 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  49.51 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1942  peptidase T  49.5 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.366024  normal  0.129304 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  50.87 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1094  peptidase T  51.49 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.357945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0410  peptidase T  47.9 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.88832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0772  peptidase T  49.75 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.340472  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  46.44 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  44.79 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1996  peptidase T  47.09 
 
 		 413 aa  364  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  48.77 
 
 		 406 aa  362  8e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  45.7 
 
 		 427 aa  349  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  45.72 
 
 		 417 aa  349  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1109  peptidase T  43.66 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  44.39 
 
 		 411 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  44.88 
 
 		 410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  43.77 
 
 		 410 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  44.61 
 
 		 417 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  43.28 
 
 		 408 aa  334  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  43.63 
 
 		 418 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  43.73 
 
 		 414 aa  332  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  43.14 
 
 		 430 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  43.64 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0998  peptidase T  41.98 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  42.18 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  41.75 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  42.51 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  41.83 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  41.77 
 
 		 412 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  42.16 
 
 		 417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  40.1 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  41.18 
 
 		 420 aa  295  9e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0953  peptidase T  40.78 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  40.05 
 
 		 415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  38.48 
 
 		 411 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  37.5 
 
 		 418 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5042  peptidase T  39.41 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.918686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2412  peptidase T  38.38 
 
 		 416 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5411  peptidase T  39.16 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.683579  normal  0.180292 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  37.29 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1976  peptidase T  38.27 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2506  peptidase T  36.67 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2931  peptidase T  38.52 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0680  peptidase T  36.67 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  34.89 
 
 		 414 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>