70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  94.58 
 
 
203 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  57.64 
 
 
204 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  32.34 
 
 
207 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  32.34 
 
 
207 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  34.57 
 
 
203 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  36.6 
 
 
201 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  31.63 
 
 
217 aa  98.2  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  34.04 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  38.86 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  44.2 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  38.59 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  37.1 
 
 
214 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  30.77 
 
 
204 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  38.25 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  30.69 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
435 aa  88.2  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  33.82 
 
 
216 aa  88.2  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
458 aa  86.3  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  31.96 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  39.85 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  35.6 
 
 
194 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  29.95 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  31.16 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  32.43 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  33.52 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  37.77 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  34.9 
 
 
568 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  31.47 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  35.54 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  26.47 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  28.95 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  31.72 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  30.46 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  27.08 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  29.63 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  35.04 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  39.02 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  36.76 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
441 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  27.98 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  29.23 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  27.88 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  26.15 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  30.7 
 
 
254 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  26.15 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  28.14 
 
 
244 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  29.84 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  35.2 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  29.23 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  26.42 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  34.45 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  34.17 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  26.26 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  23.86 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  43.33 
 
 
290 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  37.25 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  38.14 
 
 
243 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  32.52 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  36.67 
 
 
270 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  43.08 
 
 
459 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  32.86 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  20.3 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  28.46 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06281  hypothetical protein  27.93 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0473022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  29.23 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  22.16 
 
 
203 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  35.71 
 
 
507 aa  41.6  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  20.2 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>