More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_16780  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  847    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1460  hypothetical protein  98.3 
 
 
425 aa  812    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  29.25 
 
 
459 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  29.07 
 
 
457 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  28.72 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  26.3 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  26.88 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  29.05 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  26.05 
 
 
433 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  26.17 
 
 
466 aa  131  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  28.47 
 
 
461 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  26.93 
 
 
1380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  27 
 
 
1365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.93 
 
 
1373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  26.82 
 
 
448 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  27.36 
 
 
445 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  26.68 
 
 
1373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  42.55 
 
 
429 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  26.93 
 
 
1373 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  25.39 
 
 
469 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.93 
 
 
1373 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.93 
 
 
1373 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.93 
 
 
1373 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.93 
 
 
1373 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  26.65 
 
 
444 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  29.5 
 
 
455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  28.03 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  27.85 
 
 
462 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  24 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  27.44 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  42.26 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  26.49 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  26.65 
 
 
462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  27.49 
 
 
452 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1689  cytochrome P450  27.58 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163805  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  25.54 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  26.48 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  25.58 
 
 
452 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  26.37 
 
 
473 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  26.37 
 
 
473 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  37.69 
 
 
489 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  28 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  25.97 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  27.78 
 
 
465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  28.17 
 
 
473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  25.12 
 
 
454 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  26.76 
 
 
461 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  24.19 
 
 
454 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  23.13 
 
 
448 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  32.52 
 
 
445 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  24.71 
 
 
451 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  38.6 
 
 
459 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  26.27 
 
 
444 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  27.11 
 
 
480 aa  107  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  38.6 
 
 
459 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  34.55 
 
 
455 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  22.98 
 
 
546 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  28.38 
 
 
446 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7149  P-450 monooxygenase  36.59 
 
 
456 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  24.76 
 
 
461 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  34.71 
 
 
462 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  25.81 
 
 
470 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  26.65 
 
 
450 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  25.98 
 
 
467 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  24.76 
 
 
495 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  28.28 
 
 
463 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  27.86 
 
 
453 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  27.36 
 
 
453 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  35.06 
 
 
447 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  28.1 
 
 
453 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  25.06 
 
 
452 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  38.6 
 
 
452 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  27.86 
 
 
453 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  26.85 
 
 
478 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  24.34 
 
 
484 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  27.36 
 
 
457 aa  99.8  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  26.3 
 
 
453 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  25.43 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  28.93 
 
 
508 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  26.14 
 
 
459 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  25.93 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  28.42 
 
 
457 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  33.89 
 
 
455 aa  96.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  36.21 
 
 
468 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  30.81 
 
 
457 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  28.27 
 
 
484 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  23.58 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  32.2 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  24.09 
 
 
447 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  25.29 
 
 
468 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  32.76 
 
 
441 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  24.85 
 
 
474 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  24.85 
 
 
474 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  32.67 
 
 
446 aa  93.6  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  26.85 
 
 
452 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  25.15 
 
 
453 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  25.6 
 
 
464 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  30 
 
 
459 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  25.91 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  26.73 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>