65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_05120  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0491  hypothetical protein  98.21 
 
 
56 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  72.73 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  74.51 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  67.27 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  55.1 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  55.1 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  52 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  52 
 
 
96 aa  59.3  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  51.02 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  51.02 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  51.02 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  51.02 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  48.98 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  47.06 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  47.06 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  54.35 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  51.06 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  53.19 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  45.1 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  57.78 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  53.06 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  52 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  52 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  45.1 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  54.76 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  51.02 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  52 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  46.94 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  44.9 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  43.64 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  44.68 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  45.65 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  45.65 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  45.65 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  45.65 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2620  hypothetical protein  39.62 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  52.78 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0749  hypothetical protein  43.48 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000231934  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  52.17 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2104  hypothetical protein  39.58 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0253  protein of unknown function DUF167  39.22 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1715  protein of unknown function DUF167  39.58 
 
 
101 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.625283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2664  hypothetical protein  41.3 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0569679  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  46.34 
 
 
86 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  52.08 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  46.94 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0145  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2508  protein of unknown function DUF167  37.5 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  48.72 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  48.72 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>