More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04031 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_04031  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.278475  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0362  phosphomethylpyrimidine kinase  77.99 
 
 
259 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03941  phosphomethylpyrimidine kinase  76.83 
 
 
259 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03951  phosphomethylpyrimidine kinase  75.29 
 
 
259 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.941064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 
271 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2379  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
263 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
275 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 
260 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 
278 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
279 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
274 aa  208  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  45.97 
 
 
269 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
269 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 
264 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
268 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
288 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.31 
 
 
270 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
260 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 
268 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
271 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  41.09 
 
 
272 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 
268 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 
270 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
257 aa  192  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 
266 aa  191  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  35.91 
 
 
267 aa  191  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
288 aa  191  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
288 aa  191  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 
273 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  39.47 
 
 
266 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  41.11 
 
 
260 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 
264 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 
267 aa  190  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
267 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
285 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  35.52 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
449 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  39.13 
 
 
436 aa  189  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 
270 aa  188  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 
450 aa  188  7e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.38 
 
 
268 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 
266 aa  188  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  40.39 
 
 
271 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 
269 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  38.67 
 
 
264 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
271 aa  186  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  36.92 
 
 
266 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 
280 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  39.33 
 
 
268 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
279 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 
264 aa  185  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  36.92 
 
 
266 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  36.92 
 
 
266 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
270 aa  185  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  185  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  185  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  185  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  185  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  36.54 
 
 
266 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
270 aa  184  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  41.49 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  39.37 
 
 
449 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
270 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
273 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  41.56 
 
 
497 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.52 
 
 
263 aa  182  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
266 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  37.85 
 
 
444 aa  182  6e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
270 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
270 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
270 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
270 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  35.91 
 
 
267 aa  181  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  36.05 
 
 
267 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  40.33 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
276 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 
264 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 
285 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
276 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>