More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  100 
 
 		 605 aa  1219    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  70.07 
 
 		 613 aa  871    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  70.27 
 
 		 612 aa  898    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  41.2 
 
 		 610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  39.57 
 
 		 611 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  39.57 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  34.91 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  32.2 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  33.2 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  32 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  31.95 
 
 		 600 aa  253  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  36.85 
 
 		 583 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  33.82 
 
 		 613 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 		 599 aa  238  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  31.3 
 
 		 605 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  32.59 
 
 		 603 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  32.1 
 
 		 586 aa  232  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  31.91 
 
 		 583 aa  231  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  31.91 
 
 		 596 aa  229  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  33.93 
 
 		 596 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  30.04 
 
 		 600 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.64 
 
 		 587 aa  226  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  29.08 
 
 		 576 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.69 
 
 		 583 aa  220  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.9 
 
 		 582 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  28.65 
 
 		 599 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  31.06 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.63 
 
 		 597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.44 
 
 		 594 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.74 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  31.73 
 
 		 568 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.2 
 
 		 587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  28.33 
 
 		 586 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.43 
 
 		 579 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  30.34 
 
 		 628 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30 
 
 		 589 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.87 
 
 		 611 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.87 
 
 		 611 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  31.87 
 
 		 611 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  29.89 
 
 		 599 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  28.65 
 
 		 575 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.6 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  31.46 
 
 		 585 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.24 
 
 		 579 aa  209  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  32.39 
 
 		 610 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.61 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.61 
 
 		 593 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.33 
 
 		 581 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 582 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  27.95 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  31.12 
 
 		 593 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.84 
 
 		 600 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  28.25 
 
 		 612 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.67 
 
 		 610 aa  207  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  38.32 
 
 		 626 aa  207  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.84 
 
 		 596 aa  207  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.74 
 
 		 583 aa  207  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  29.35 
 
 		 594 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.04 
 
 		 596 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.04 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.04 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.04 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.17 
 
 		 597 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  28.94 
 
 		 594 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.04 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.04 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.04 
 
 		 596 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.61 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.61 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.36 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  29.55 
 
 		 580 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.61 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.27 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.31 
 
 		 590 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  27.95 
 
 		 588 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.1 
 
 		 597 aa  204  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.12 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.83 
 
 		 582 aa  203  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  29.68 
 
 		 580 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.93 
 
 		 583 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.91 
 
 		 596 aa  203  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  26.43 
 
 		 604 aa  203  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.93 
 
 		 593 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  29.64 
 
 		 601 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.36 
 
 		 597 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.93 
 
 		 623 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  27.63 
 
 		 550 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>