41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14561 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  100 
 
 
352 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  46.3 
 
 
328 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  46.28 
 
 
313 aa  268  7e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  43.25 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  39.49 
 
 
315 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  39.42 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  39.86 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  38.89 
 
 
314 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  39.53 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  38.96 
 
 
314 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  31.8 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  29.83 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  30.33 
 
 
359 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  29.83 
 
 
349 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  28.38 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  29.18 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  26.67 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  30.13 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  27.07 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  29.29 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  27.64 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  29.46 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  31.6 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  30.9 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  26.32 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  24.1 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  27.94 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  27.8 
 
 
288 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
312 aa  62.8  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  28.14 
 
 
300 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  26.55 
 
 
371 aa  59.7  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  27.23 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  28.65 
 
 
1320 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  24.41 
 
 
198 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  28.07 
 
 
504 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  28.47 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.2 
 
 
555 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  40.32 
 
 
211 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  25.42 
 
 
198 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  25.42 
 
 
198 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>