24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05501 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  100 
 
 
389 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  89.2 
 
 
389 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  94.86 
 
 
389 aa  764    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  78.96 
 
 
392 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  53.23 
 
 
389 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  52.08 
 
 
384 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  50.91 
 
 
387 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  49.87 
 
 
384 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  52.21 
 
 
386 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  52.21 
 
 
386 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  45.95 
 
 
388 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  45.22 
 
 
435 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  31.36 
 
 
368 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  153  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  26.51 
 
 
472 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  26.05 
 
 
484 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  23.1 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  22.7 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  22.11 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  20.92 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  22.73 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  20.26 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  27.42 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  21.65 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>