109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0052 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0040  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0457  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.174165  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309361  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0030  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0034  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0528002  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00058  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t72  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0449352  hitchhiker  0.00732029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t57  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA64  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0073  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R18  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104316  normal  0.0469264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R53  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0125936  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  81.71 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu04  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.353437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41320  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73657  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62800  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07695  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0038  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000269162  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0065  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0095  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3504  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5466  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138574  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02743  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05676  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05682  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4701  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000616666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5072  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000520026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116004  normal  0.383928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3470  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00513731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3660  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0342114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000721197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.0213265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000127557  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3551  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3587  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.453688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000684765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000344559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3481  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241057  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3649  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3171t  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0569623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3174t  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000836085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4496  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00806213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60360  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0071  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0078  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>