24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3627 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  999    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  47.67 
 
 		 537 aa  435  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  57.71 
 
 		 486 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  57.62 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  59.23 
 
 		 447 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  46.68 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  46.24 
 
 		 420 aa  350  5e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  46.43 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  46.43 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  45.78 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  46.41 
 
 		 416 aa  319  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  45.01 
 
 		 419 aa  316  7e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  44.99 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  44.67 
 
 		 419 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  48.85 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  45.17 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  46.07 
 
 		 420 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  44.47 
 
 		 416 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  44.52 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  46.14 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  42.19 
 
 		 420 aa  283  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  40.79 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  49.11 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  29.37 
 
 		 450 aa  211  4e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>