25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2444 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  28.08 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  26.48 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  26.23 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  27.96 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  28.33 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  27.78 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  23.98 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  22.87 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  23.9 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  23.9 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  25.12 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  22.12 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  27.72 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  25.93 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  25.79 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  27.35 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  23.38 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  25.68 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  26 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  23.37 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  27.59 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  22.73 
 
 		 473 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  19.8 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  28.17 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>