More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1473 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1473  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  204  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
107 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  51.22 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  57.33 
 
 
74 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  47.44 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.37 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.76 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.05 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  54.67 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.38 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  54.05 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  53.42 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  53.66 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  44.74 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  51.35 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  52.63 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  54.55 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  41.98 
 
 
81 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  41.98 
 
 
81 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  54.05 
 
 
76 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  52.56 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  56.52 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
98 aa  77  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  54.43 
 
 
93 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.7 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  47.3 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.7 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.7 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  52.56 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  47.3 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  43.04 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  48.75 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.7 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 
71 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  45.24 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  54.05 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  51.14 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  57.81 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  44.74 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  39.47 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  48.68 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
72 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  52.11 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  51.85 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  48.72 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  53.09 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  56.25 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  44.87 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  50.7 
 
 
72 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  54.29 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  56.52 
 
 
85 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  50.7 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  53.09 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  57.35 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  45.65 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  48.61 
 
 
71 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  49.3 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  44.68 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  44.59 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  47.22 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  51.39 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  50.7 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  51.35 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  51.25 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  49.33 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  44.59 
 
 
68 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  56.25 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  47.3 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>