272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0782 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0782  thymidylate synthase  100 
 
 
319 aa  665    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.412058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  72.98 
 
 
322 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  64.24 
 
 
320 aa  430  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  62.38 
 
 
318 aa  419  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  59.87 
 
 
318 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  58.93 
 
 
318 aa  411  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  59.56 
 
 
318 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  59.25 
 
 
318 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  58.93 
 
 
318 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  58.93 
 
 
318 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  58.93 
 
 
318 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  58.62 
 
 
318 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  58.93 
 
 
318 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  58.93 
 
 
318 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  58.31 
 
 
318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  58.1 
 
 
318 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  58.1 
 
 
318 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  57.05 
 
 
318 aa  374  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  57.05 
 
 
318 aa  374  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  47.6 
 
 
264 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  46.67 
 
 
285 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  46.15 
 
 
286 aa  286  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  45.86 
 
 
264 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  47.28 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  47.13 
 
 
264 aa  282  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  47.12 
 
 
264 aa  279  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  47.12 
 
 
264 aa  279  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  47.13 
 
 
264 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  45.37 
 
 
264 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  45.83 
 
 
264 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl419  thymidylate synthase  45.71 
 
 
288 aa  276  2e-73  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0183487  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  45.4 
 
 
264 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  46.47 
 
 
264 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  46.5 
 
 
264 aa  276  3e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  46.5 
 
 
264 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  45.86 
 
 
264 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  46.15 
 
 
264 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  45.05 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  45.71 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  44.27 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  45.22 
 
 
264 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  45.19 
 
 
264 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  45.19 
 
 
264 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  45.37 
 
 
264 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  45.82 
 
 
300 aa  272  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  45.54 
 
 
264 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  44.87 
 
 
264 aa  272  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  45.08 
 
 
264 aa  271  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  45.51 
 
 
267 aa  271  9e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  44.87 
 
 
264 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  44.27 
 
 
264 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  45.22 
 
 
264 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  45.54 
 
 
264 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  44.9 
 
 
264 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  45.4 
 
 
264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  43.95 
 
 
264 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  45.37 
 
 
264 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  44.14 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  45.54 
 
 
264 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  44.73 
 
 
264 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  43.45 
 
 
283 aa  267  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  43.27 
 
 
264 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  44.27 
 
 
264 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  43.22 
 
 
267 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  45.22 
 
 
264 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  45.22 
 
 
264 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  45.08 
 
 
283 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  44.41 
 
 
274 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  45.22 
 
 
264 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  43.45 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  45.86 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  43.31 
 
 
264 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  44.87 
 
 
280 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  42.51 
 
 
277 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  45.19 
 
 
265 aa  265  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  44.59 
 
 
264 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  44.87 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  43.91 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  44.55 
 
 
272 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  45.54 
 
 
277 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  44.9 
 
 
264 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  43.12 
 
 
277 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  44.23 
 
 
264 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  42.81 
 
 
277 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  44.59 
 
 
264 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  44.23 
 
 
267 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  43.27 
 
 
278 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  43.91 
 
 
264 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  43.95 
 
 
264 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  43.31 
 
 
264 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  43.45 
 
 
271 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  43.49 
 
 
265 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  43.81 
 
 
290 aa  261  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  43.81 
 
 
290 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  42.49 
 
 
264 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  44.23 
 
 
266 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  44.23 
 
 
266 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  43.91 
 
 
267 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  44.23 
 
 
266 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  44.87 
 
 
263 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.470596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>