31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1629 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  100 
 
 
666 aa  1377    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  42.68 
 
 
695 aa  102  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  26.96 
 
 
647 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  27.6 
 
 
466 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  24.14 
 
 
717 aa  60.5  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.49 
 
 
681 aa  58.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  24.32 
 
 
590 aa  58.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.49 
 
 
681 aa  57.4  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  32.26 
 
 
746 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  32.26 
 
 
746 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  28.5 
 
 
362 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  28.43 
 
 
299 aa  54.7  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.07 
 
 
678 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  22.4 
 
 
679 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  26.86 
 
 
756 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  28.04 
 
 
796 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  22.62 
 
 
734 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.63 
 
 
289 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  36.23 
 
 
620 aa  47.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  29.66 
 
 
382 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  27.15 
 
 
759 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  34.78 
 
 
465 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
494 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  27.53 
 
 
294 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  32.89 
 
 
615 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  32.89 
 
 
615 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  25.15 
 
 
421 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.13 
 
 
955 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  26.9 
 
 
751 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  29.07 
 
 
621 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  44.3  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>