40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4330 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  991    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  40 
 
 		 685 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8845  hypothetical protein  40.5 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4450  hypothetical protein  41.25 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385348  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.69 
 
 		 609 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5044  hypothetical protein  35 
 
 		 769 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.18 
 
 		 364 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.23 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.07 
 
 		 627 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.15 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.19 
 
 		 372 aa  57  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.28 
 
 		 160 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.54 
 
 		 508 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 635 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 128 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 1089 aa  50.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.43 
 
 		 327 aa  50.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.33 
 
 		 792 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.48 
 
 		 224 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.91 
 
 		 182 aa  50.4  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.06 
 
 		 317 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.23 
 
 		 201 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.48 
 
 		 323 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  40 
 
 		 239 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  41.79 
 
 		 228 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  43.75 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2364  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.39 
 
 		 92 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.5 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0539  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 464 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 170 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.43 
 
 		 280 aa  43.5  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 300 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 266 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.32 
 
 		 309 aa  43.5  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 306 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>