25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2575 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  463  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  44.44 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  41.79 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  38.36 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  37.55 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  40.53 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  37.83 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  34.18 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  39.07 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  38.82 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  32.55 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  34.63 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  37.21 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  34.71 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  38.04 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1176  hypothetical protein  33.19 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  28.52 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  30.15 
 
 		 290 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  35.75 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15850  hypothetical protein  34.44 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  29.67 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  27.63 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  29.67 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  29.67 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>