24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2290 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  829    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  70.81 
 
 
430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  68.82 
 
 
416 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  69.06 
 
 
416 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  66.9 
 
 
419 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  66.27 
 
 
419 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  59.41 
 
 
416 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  57.45 
 
 
416 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  59.51 
 
 
416 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  56.67 
 
 
419 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  55.42 
 
 
420 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  55.77 
 
 
418 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  56.93 
 
 
420 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  58.44 
 
 
419 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  54.94 
 
 
419 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  55.95 
 
 
420 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  55.01 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  54.57 
 
 
425 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  45.9 
 
 
509 aa  333  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  45.58 
 
 
537 aa  326  6e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  43.96 
 
 
486 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  44.2 
 
 
486 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  43.44 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  29.38 
 
 
450 aa  194  3e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>