109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0229 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0229  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
84 aa  167  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00664957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44250  acyl-carrier protein  44.44 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1686  phosphopantetheine-binding  37.33 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.543187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02853  conserved hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3157  putative acyl carrier protein  46.15 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3444  putative acyl carrier protein  46.15 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0716  phosphopantetheine-binding  46.15 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3262  putative acyl carrier protein  46.15 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3422  phosphopantetheine-binding  43.75 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5432  acyl carrier protein, putative  37.04 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2768  phosphopantetheine-binding  31.65 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  28.38 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0023  acyl carrier protein  35.53 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  28.38 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0846  BapB protein  40 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.708316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  35 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  45.45 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  32.89 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  34.85 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3899  hypothetical protein  20 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  25.32 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  29.58 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  31.17 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  27.63 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3075  acyl carrier protein  36.54 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117369  normal  0.374768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  28.17 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  38.18 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  31.58 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  35.71 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00523  polyketide synthase, putative (JCVI)  37.5 
 
 
2476 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657884  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  31.58 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  38.33 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  31.58 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  25.3 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  35.71 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  31.25 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  25 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  25.33 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  25.68 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  28.36 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  40.68 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  35 
 
 
80 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  25.33 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  31.08 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  25.33 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  25.33 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10032  acyl carrier protein acpA  40.43 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168088  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  32.79 
 
 
77 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  26.25 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  33.85 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  35 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1088  acyl carrier protein  43.75 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  31.15 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  29.33 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  35 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  34.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  37.04 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  29.33 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  29.33 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  29.33 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  29.33 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  27.94 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  33.85 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  35.29 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0566  acyl carrier protein  39.58 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  33.85 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2157  BapB protein  39.58 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2069  acyl carrier protein  39.58 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  32.26 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  32.26 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  36.07 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  36.36 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  34.55 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  27.63 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  31.15 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  34.55 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>