More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0684 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  100 
 
 		 369 aa  744    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  50.82 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  50 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  51.49 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  51.36 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  51.09 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  47.27 
 
 		 363 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  50.82 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  48.08 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  46.34 
 
 		 370 aa  342  8e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  48.1 
 
 		 365 aa  337  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  47.58 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.84 
 
 		 370 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  46.32 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  49.18 
 
 		 367 aa  332  9e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  47.4 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  47.19 
 
 		 370 aa  328  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  45.87 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  45.78 
 
 		 367 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  48.19 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  43.36 
 
 		 373 aa  302  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  41.8 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  44.18 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  42.93 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  41.55 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  42.45 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  39.68 
 
 		 369 aa  262  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  41.4 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  43.54 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  39.14 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  30.68 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.34 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  27.99 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  28.81 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  24.8 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  28.46 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  26.43 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  26.06 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  27.62 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  25.53 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  25.56 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  34.93 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  39.06 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.88 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  38.28 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  34.93 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.31 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  44.86 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  39.37 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  40.48 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  36.72 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  32.68 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  38.89 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  33.56 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  34.48 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.22 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  39.37 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  33.13 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  46.51 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  40.78 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.16 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  44.34 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  35.94 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  35.48 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  39.62 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.45 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  33.77 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  37.93 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  30.34 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  46.51 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  41.38 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.57 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.76 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  36.92 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  30.34 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.61 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  42.53 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  31.01 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.64 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  37.93 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  31.31 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  40 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  38.28 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.51 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.19 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  39.77 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  38.28 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  40 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>