27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0400 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  34.87 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  32.69 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  34.31 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  32.28 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  31.13 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  31.71 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  32.85 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  30.87 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  35.77 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  32.62 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  30.52 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  32.85 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  36.59 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  36.59 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  36.59 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  30.3 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  32.62 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  32.61 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  28.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  32.74 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  38.21 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  31.93 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  26.14 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  26.97 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  28.37 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  26.95 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>