More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0311 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 569 aa  1168    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 569 aa  324  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 564 aa  310  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 570 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 569 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 561 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 570 aa  301  2e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 555 aa  301  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 588 aa  300  4e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 		 555 aa  300  6e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 570 aa  296  5e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 555 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 571 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 566 aa  290  4e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 570 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 555 aa  290  7e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 634 aa  279  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 799 aa  274  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 560 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 568 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  35.32 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  39.31 
 
 		 858 aa  267  4e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 573 aa  264  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 561 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 561 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  35.38 
 
 		 749 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 570 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 565 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 557 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 580 aa  258  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 540 aa  257  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 556 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 569 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 582 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 556 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 563 aa  252  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 557 aa  250  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 597 aa  249  8e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 565 aa  249  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0681  glutaminyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 748 aa  249  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.480313  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 579 aa  248  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 556 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 609 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 559 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 552 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 555 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 567 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  33.06 
 
 		 628 aa  246  6.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 561 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 579 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 555 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 555 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 567 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 555 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 567 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 572 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 590 aa  243  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 		 559 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 554 aa  243  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 567 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 556 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 565 aa  242  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 580 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 556 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 565 aa  241  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 580 aa  241  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.352024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 590 aa  240  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  32.87 
 
 		 720 aa  240  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 556 aa  240  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  39.19 
 
 		 541 aa  240  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0613  glutaminyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 587 aa  240  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.794454  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 548 aa  240  5.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 563 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 564 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 574 aa  239  9e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 565 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 556 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 561 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 589 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 564 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 552 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 569 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 568 aa  236  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 781 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 556 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>