27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2908 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  100 
 
 		 661 aa  1273    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  52.82 
 
 		 655 aa  617  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  50.08 
 
 		 650 aa  600  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  48.62 
 
 		 647 aa  585  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  55 
 
 		 653 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  49.69 
 
 		 642 aa  554  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  37.1 
 
 		 645 aa  345  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4890  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  58.27 
 
 		 295 aa  301  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  30.33 
 
 		 601 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  68.24 
 
 		 193 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  24.32 
 
 		 587 aa  72.8  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  22.26 
 
 		 619 aa  69.3  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0350416 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.62 
 
 		 1188 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.62 
 
 		 1188 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  28.28 
 
 		 926 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0981  hypothetical protein  23.64 
 
 		 419 aa  49.7  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000423266  decreased coverage  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  25.14 
 
 		 1169 aa  47  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  25.14 
 
 		 1169 aa  47  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  26.3 
 
 		 1189 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  25.1 
 
 		 1168 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  24.89 
 
 		 1188 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  25.5 
 
 		 1202 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  23.11 
 
 		 1261 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  21.37 
 
 		 1189 aa  44.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  20.4 
 
 		 1189 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 		 1193 aa  43.9  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  25.18 
 
 		 1192 aa  43.9  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>