22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0820 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  100 
 
 
653 aa  1264    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  77.34 
 
 
655 aa  956    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  52.02 
 
 
647 aa  623  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  54.85 
 
 
661 aa  599  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  52.2 
 
 
650 aa  593  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  51.42 
 
 
642 aa  566  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4890  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  82.04 
 
 
295 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  39.56 
 
 
645 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  29.04 
 
 
601 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  67.06 
 
 
193 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  24.04 
 
 
619 aa  66.6  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0350416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  23.63 
 
 
587 aa  60.1  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.36 
 
 
1192 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.53 
 
 
1193 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  26.7 
 
 
1153 aa  50.8  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  25.82 
 
 
891 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  23.63 
 
 
1189 aa  48.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.65 
 
 
1188 aa  47.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1571  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.68 
 
 
371 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.647884  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  24.67 
 
 
694 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  24.72 
 
 
786 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  23.15 
 
 
1185 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>