16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0769 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  100 
 
 
619 aa  1242    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0350416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  50.08 
 
 
587 aa  545  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  22.82 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  23.23 
 
 
650 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  21.66 
 
 
647 aa  77.8  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  22.22 
 
 
642 aa  67.8  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  22.51 
 
 
655 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  22.41 
 
 
661 aa  63.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  21.63 
 
 
645 aa  57.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  20.49 
 
 
657 aa  47.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  37.88 
 
 
978 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  37.88 
 
 
978 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.32 
 
 
1191 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  24.63 
 
 
1149 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  24.66 
 
 
1194 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  20.68 
 
 
1148 aa  43.9  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>