16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3954 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
601 aa  1189    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  29.58 
 
 
645 aa  208  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  27.98 
 
 
650 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  28.91 
 
 
661 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  27.92 
 
 
655 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  27.27 
 
 
647 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  29.97 
 
 
642 aa  178  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  28.33 
 
 
653 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4890  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  29.18 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  22.79 
 
 
619 aa  78.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0350416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  22.71 
 
 
587 aa  61.6  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.65 
 
 
804 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  26.12 
 
 
874 aa  45.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.78 
 
 
1074 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  22.26 
 
 
922 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>