21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2244 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  100 
 
 
642 aa  1241    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  49.3 
 
 
647 aa  579  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  49.77 
 
 
650 aa  571  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  50.24 
 
 
655 aa  565  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  49.7 
 
 
661 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  51.42 
 
 
653 aa  530  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  37.91 
 
 
645 aa  334  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4890  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  54.93 
 
 
295 aa  281  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  29.97 
 
 
601 aa  190  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  72.94 
 
 
193 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  23.2 
 
 
619 aa  73.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0350416 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1193 aa  57.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  24.2 
 
 
587 aa  56.2  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2079  hypothetical protein  21.39 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0328  hypothetical protein  21.39 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2042  hypothetical protein  21.39 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0319  hypothetical protein  21.39 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  22.65 
 
 
694 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 
1188 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.94 
 
 
1235 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  26.36 
 
 
874 aa  43.9  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>