20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4125 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  100 
 
 
655 aa  1265    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  77.34 
 
 
653 aa  856    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  50.7 
 
 
647 aa  596  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  52.82 
 
 
661 aa  586  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  50.7 
 
 
650 aa  562  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  50.24 
 
 
642 aa  545  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4890  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  92.61 
 
 
295 aa  501  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  40.5 
 
 
645 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  27.92 
 
 
601 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  64.71 
 
 
193 aa  107  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  24.67 
 
 
587 aa  74.3  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  24.59 
 
 
619 aa  58.9  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0350416 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  22.82 
 
 
1148 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.68 
 
 
1193 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  25.38 
 
 
3608 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.13 
 
 
1621 aa  48.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  24.18 
 
 
1082 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.73 
 
 
1185 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  25.21 
 
 
1192 aa  45.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  24.31 
 
 
702 aa  44.3  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>