27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2048 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  100 
 
 		 647 aa  1276    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  51.71 
 
 		 650 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  50.7 
 
 		 655 aa  596  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  49.3 
 
 		 642 aa  558  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  52.02 
 
 		 653 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  48.16 
 
 		 661 aa  552  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  38.08 
 
 		 645 aa  336  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4890  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  54.93 
 
 		 295 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  27.41 
 
 		 601 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  63.53 
 
 		 193 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  21.27 
 
 		 619 aa  73.9  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0350416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  23.32 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 		 1193 aa  58.9  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  26.91 
 
 		 3608 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  22.57 
 
 		 694 aa  51.6  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.38 
 
 		 702 aa  51.2  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  21.23 
 
 		 1621 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.59 
 
 		 1192 aa  48.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  22.29 
 
 		 993 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.27 
 
 		 924 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0045  hypothetical protein  38.82 
 
 		 847 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.370915  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.51 
 
 		 926 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.39 
 
 		 1185 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 		 1189 aa  45.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1075  chromosome segregation ATPase-like protein  23.18 
 
 		 1206 aa  44.3  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24.78 
 
 		 858 aa  44.3  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  24.4 
 
 		 1051 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>