17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4714 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
645 aa  1259    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  40.5 
 
 
655 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  34.54 
 
 
650 aa  359  7e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  38.39 
 
 
647 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  35.44 
 
 
661 aa  347  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  38.98 
 
 
653 aa  337  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  37.11 
 
 
642 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  30.25 
 
 
601 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4890  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  43.64 
 
 
295 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  46.99 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  20.75 
 
 
619 aa  70.1  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0350416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  23.09 
 
 
587 aa  62.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.06 
 
 
1193 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  24.44 
 
 
702 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  36.36 
 
 
569 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3638  chromosome segregation ATPase-like protein  30 
 
 
480 aa  45.8  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  22.74 
 
 
533 aa  44.3  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>